一、解放前南京醫(yī)科大研究生教育
        南京醫(yī)科大學(xué)研究生教育歷史可追溯到解放前。1929年，國(guó)民黨南京政府公布了《大學(xué)組織法》和《大學(xué)規(guī)程》，規(guī)定了高等教育機(jī)關(guān)分為大學(xué)、獨(dú)立學(xué)院、?？茖W(xué)校和研究院（所），并指出，大學(xué)研究院（所）的任務(wù)是招收大學(xué)畢業(yè)生研究高深學(xué)術(shù)，各研究生研究期限暫定為至少3年。1935年，國(guó)民黨政府公布了《學(xué)位授予法》、同年教育部頒布了《學(xué)位分級(jí)細(xì)則》、《碩士學(xué)位考試細(xì)則》，1940年教育部又頒發(fā)了《博士學(xué)位評(píng)定會(huì)組織法》和《博士學(xué)位考試細(xì)則》，這個(gè)時(shí)期研究生教育有了立法程序，有了一套比較完整的制度。我校于1942年7月奉令成立醫(yī)科研究所寄生蟲學(xué)部，由部聘教授洪式閭博士兼主任。至1947年5月奉指令，改組為國(guó)立江蘇醫(yī)學(xué)院寄生蟲學(xué)研究所。1942年12月本所招收第一屆研究生兼助教趙慰先一名，1943年8月招收第二屆研究生王培信、王毓楹二名。并于1945年8月及1946年1月由研究生王培信及趙慰先提出碩士論文各一篇，參與碩士考試及格，經(jīng)部復(fù)核審查通過授予碩士學(xué)位。
        在解放前，由于舊中國(guó)的教育和科技落后，只有少數(shù)學(xué)校招收過為數(shù)不多的研究生。據(jù)統(tǒng)計(jì)從1935年至1949年全國(guó)授予碩士學(xué)位人數(shù)才200多人，沒有授予過博士學(xué)位。

二、新中國(guó)成立后南京醫(yī)科大研究生教育
        新中國(guó)成立以后，我國(guó)從1950年開始招收研究生。1953年11月27日，高等教育部發(fā)布了《高等學(xué)校培養(yǎng)研究生暫行辦法（草案）》，明確規(guī)定：“……師資條件較好的高等學(xué)校應(yīng)擔(dān)負(fù)培養(yǎng)研究生的任務(wù)，其目的為培養(yǎng)高等學(xué)校師資和科學(xué)研究人才”。1961年9月，中共中央印發(fā)了《中華人民共和國(guó)教育部直屬高等學(xué)校暫行工作條例（草案）》，對(duì)我國(guó)研究生教育作了具體規(guī)定和要求。1963年，教育部在北京召開了研究生工作會(huì)議，會(huì)議通過了《高等學(xué)校培養(yǎng)研究生工作暫行條例（草案）》、《關(guān)于高等學(xué)校制定理工農(nóng)醫(yī)各專業(yè)培養(yǎng)方案的幾項(xiàng)規(guī)定（草案）》、《關(guān)于高等學(xué)校培養(yǎng)研究生學(xué)籍處理的幾項(xiàng)規(guī)定》等文件，從此我國(guó)高等學(xué)校、科研機(jī)構(gòu)研究生工作逐步走上軌道，到1965年，我國(guó)培養(yǎng)研究生的高等學(xué)校有134所，科研機(jī)構(gòu)100個(gè)，在校研究生人數(shù)為4546人，畢業(yè)研究生15942人。在此期間，我校共培養(yǎng)研究生14人。1966年，由于發(fā)生了“文化大革命”，通過研究生入學(xué)考試的研究生沒能入學(xué)，我校共有4人。

三、恢復(fù)研究生招生后南京醫(yī)科大學(xué)研究生教育
        1977年10月12日，國(guó)務(wù)院轉(zhuǎn)發(fā)了教育部《關(guān)于做好1977年高等學(xué)校招生工作的意見》，該文件對(duì)全國(guó)研究生招生工作做了統(tǒng)一的部署，并對(duì)研究生的培養(yǎng)目標(biāo)有了明確的要求：應(yīng)具有系統(tǒng)而堅(jiān)實(shí)的的基礎(chǔ)理論、專業(yè)知識(shí)和科學(xué)實(shí)驗(yàn)的技能，能獨(dú)立進(jìn)行科學(xué)研究工作。1978年1月教育部在《關(guān)于高等學(xué)校1978年研究生招生工作安排意見》中明確了1977年和1978年兩年的研究生招生工作合并于1978年進(jìn)行統(tǒng)稱為1978年研究生。1980年2月12日，中華人民共和國(guó)第五屆全國(guó)人民代表大會(huì)常務(wù)委員會(huì)第十三次會(huì)議通過了《中華人民共和國(guó)學(xué)位條例》，并宣布自1981年1月1日起實(shí)行。隨后國(guó)家又制定了《中華人民共和國(guó)學(xué)位條例暫行實(shí)施細(xì)則》。從1978年恢復(fù)研究生招生到1981年的學(xué)位制度建立至今，我校的研究生教育和全國(guó)的研究生教育一樣經(jīng)歷了四個(gè)階段：

(一)1978年～1981年為恢復(fù)時(shí)期
1. 在這一時(shí)期主要確定招生學(xué)科，擬定入學(xué)考試辦法，制定各學(xué)科專業(yè)研究生培養(yǎng)方案及有關(guān)規(guī)章制度；
2. 積極組織學(xué)位點(diǎn)申報(bào)，1981年我校被國(guó)務(wù)院學(xué)位委員會(huì)批準(zhǔn)為首批博士學(xué)位授予單位，這為我校今后的研究生教育發(fā)展打下了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。
這一時(shí)期我校研究生招生規(guī)模較少，處于恢復(fù)階段：  

(二)1982年～1987年為發(fā)展和改革時(shí)期
1. 為適應(yīng)這一時(shí)期我國(guó)經(jīng)濟(jì)建設(shè)和社會(huì)發(fā)展需要，努力擴(kuò)大研究生招生規(guī)模。抓住第二批和第三批學(xué)位點(diǎn)申報(bào)的機(jī)遇，使學(xué)位授權(quán)點(diǎn)有所擴(kuò)大，研究生招生規(guī)模顯著增加： 

2. 大膽改革，拓寬培養(yǎng)途徑。改革招生辦法，擴(kuò)大在職人員錄取比例，對(duì)本科畢業(yè)四年以上的在職人員實(shí)行“單獨(dú)考試”制度，優(yōu)先錄取優(yōu)秀的在職人員；開展臨床應(yīng)用型人才培養(yǎng)的試點(diǎn)工作；嘗試與國(guó)內(nèi)、外高校聯(lián)合培養(yǎng)研究生，拓寬研究生培養(yǎng)途徑。
3. 為適應(yīng)研究生規(guī)模迅速發(fā)展的需要，我校先后成立了研究生科和研究生處，加強(qiáng)了管理隊(duì)伍的建設(shè)。

(三)1988年～1990年為治理整頓和調(diào)整時(shí)期
1. 隨著研究生規(guī)模的不斷擴(kuò)大，改革進(jìn)一步深入，為進(jìn)一步提高研究生培養(yǎng)質(zhì)量，接受了高校研究生教育的檢查評(píng)估，肯定了我校研究生教育的成績(jī)，提出了改進(jìn)意見和要求。
2. 修訂研究生培養(yǎng)方案和有關(guān)規(guī)章制度、加強(qiáng)研究生的外語教學(xué)、改進(jìn)研究生的思想政治教育。
3. 召開了首屆研究生教育工作大會(huì)。大會(huì)統(tǒng)一了認(rèn)識(shí)，總結(jié)了經(jīng)驗(yàn)，提出了今后的發(fā)展方向。
在治理整頓階段，研究生招生規(guī)模處于穩(wěn)定發(fā)展階段： 

(四)1991年～2006年為大發(fā)展時(shí)期
1. 通過治理整頓，研究生的教育質(zhì)量有了較大的提高。為進(jìn)一步適應(yīng)我國(guó)經(jīng)濟(jì)的迅速發(fā)展，加快高層次人才培養(yǎng)已成為這一階段的主要任務(wù)，研究生招生規(guī)模明顯擴(kuò)大： 

2. 積極組織學(xué)位點(diǎn)申報(bào)，獲得了七個(gè)一級(jí)學(xué)科碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，三個(gè)一級(jí)學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，使博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)復(fù)蓋了所有的醫(yī)學(xué)學(xué)科。為我校“十一五”發(fā)展奠定了很強(qiáng)的學(xué)科基礎(chǔ)。